La parte più profonda di un mare o di un oceano non riceve la luce del sole nemmeno durante il giorno. Gli organismi che risiedono nella parte più profonda del mare o dell'oceano hanno il vantaggio della luce nel loro corpo per natura.
Questa caratteristica negli animali è chiamata bioluminescenza. Questo li aiuta a predare e talvolta anche a nascondersi dai predatori. Alcuni usano anche questo mentre usiamo una torcia.
La sostanza chimica che aiuta a creare questa luminescenza è diversa in ogni organismo. L'Aequorea victoria è una medusa che pone GFP per la bioluminescenza.
Per saperne di più su questa proteina, ecco alcune differenze tra GFP e YFP.
Punti chiave
- La GFP (Green Fluorescent Protein) emette luce verde se esposta alla luce blu, mentre la YFP (Yellow Fluorescent Protein) emette luce gialla.
- GFP ha un'intensità di fluorescenza maggiore rispetto a YFP.
- YFP è meno sensibile alle variazioni di pH rispetto a GFP.
GFP vs YFP
GFP (Green Fluorescent Protein) è presente nelle meduse. Produce luce verde se esposto a sfocatura dei raggi UV. Il suo picco di eccitazione è di 395 nm e il picco di emissione è di 515 nm. YFP (Yellow Fluorescent Protein) ha una lunghezza d'onda di eccitazione di 514 nm e una lunghezza d'onda di emissione di 527 nm.
La forma completa di GFP è la proteina fluorescente verde. Si trova in una medusa conosciuta come Aequorea Victoria.
La caratteristica principale di GFP è che emette fluorescenza verde quando esposto a raggi ultravioletti sfocati. Questa proteina è composta da 238 aminoacidi.
Ha anche alcune versioni migliorate, utilizzate principalmente per esperimenti. Questi sono usati per produrre nuovi geni di biologia cellulare e molecolare.
La forma completa di YFP è la proteina fluorescente gialla. È la versione attenuata della proteina fluorescente verde trovata in Aequorea Victoria.
Questa proteina emette fluorescenza gialla quando esposta ai raggi UV blu. Questo ha tre versioni migliorate.
Quelli sono Ypet, Citrine e Venus. Questa proteina è anche utilizzata per esperimenti in cellule e biologia molecolare.
Tavola di comparazione
Parametri di confronto | GFP | YFP |
---|---|---|
Modulo completo | Proteina fluorescente verde | Proteina fluorescente gialla |
Derivato da | Aequorea Victoria, che è un tipo di medusa | Il mutante genetico della proteina fluorescente verde |
Picco di eccitazione (lunghezza d'onda) | 395 nm | 515 nm |
Picco di emissione (lunghezza d'onda) | 509 nm | 527 nm |
Versioni migliorate | smRS-GFP | Ypet, Citrino, Venere |
Cos'è GFP?
La forma completa di GFP è la proteina fluorescente verde. Si trova in una medusa conosciuta come Aequorea Victoria.
La caratteristica principale di GFP è che emette fluorescenza verde quando esposto a raggi ultravioletti sfocati.
Questa proteina è composta da 238 aminoacidi. La sua massa molecolare è 27kD. Ha anche alcune versioni migliorate, utilizzate principalmente per esperimenti.
Questa proteina ha le lunghezze d'onda di fluorescenza del tipo di emissione e del tipo di eccitazione. Il picco di emissione è l'intervallo in cui il raggio viene emesso e il picco di eccitazione è quando i fotoni si eccitano e iniziano a emettere luce.
Il picco di eccitazione è di 395 nm e il picco di emissione è di 515 nm.
GFP ha importanti applicazioni nella ricerca di cellule e molecole. Gli scienziati usano questa proteina come a reporter gene nelle cellule e molecolare.
Il gene reporter è un tipo di gene legato ad un altro gene che viene utilizzato per l'esperimento in sequenza ed è facilmente identificabile rispetto al gene principale. Questo è usato come gene reporter a causa delle sue caratteristiche di bioluminescenza.
Questa proteina ha anche molti altri vantaggi. Questo gene è ereditario e non reagisce biologicamente con altri geni. Quindi per la ricerca, questo gene è per lo più preferito.
Cos'è YFP?
La forma completa di YFP è la proteina fluorescente gialla. È la versione attenuata della proteina fluorescente verde trovata in Aequorea Victoria.
Questa proteina emette fluorescenza gialla quando esposta ai raggi UV blu. Questo ha tre versioni migliorate.
Quelli sono Ypet, Citrine e Venus. Questa proteina è utilizzata anche per esperimenti in microbiologia.
La proteina fluorescente gialla si forma dopo quattro mutazioni della varietà selvatica di proteina fluorescente verde che si trova nella medusa di acque profonde Aequorea Victoria. I cambiamenti principali e più importanti della mutazione sono la sostituzione della treonina con un'altra sostanza chimica chiamata tirosina nella posizione di 203.
Questo cambiamento ha dato vita alla variante YFP. Il picco di eccitazione di YFP è di 515 nm e il picco di emissione è di 527 nm. Entrambi i picchi sono più alti rispetto al genitore GFP.
Le versioni migliorate dell'YFP che sono Ypet, Citrine e Venus, hanno alcuni vantaggi in più rispetto alla loro proteina madre. Quelle sono che queste varianti migliorate hanno una maturazione più rapida, una maggiore luminescenza e una ridotta sensibilità al cloruro rispetto al genitore YFP.
L'YFP è utilizzato anche nel campo della biologia cellulare e molecolare. L'YFP è utilizzato principalmente come accettori per i geni del sensore codificati geneticamente.
La variante Venus ha un cambiamento nella nuova sequenza di aminoacidi.
Principali differenze tra GFP e YFP
- Le forme complete di GFP sono proteine fluorescenti verdi, mentre YFP è proteine fluorescenti gialle.
- La GFP deriva da una medusa chiamata Aequorea victoria, mentre la YFP è la variante mutante della GFP.
- Il picco di eccitazione nella lunghezza d'onda di GFP è 395 nm, mentre quello di YFP è 515 nm.
- Il picco di emissione di GFP in lunghezze d'onda è di 509 nm, mentre quello di YFP è di 527 nm.
- Le versioni migliorate per facilitare la ricerca di GFP sono smRS-GFP, mentre quella di YFP è Ypet, Citrine e Venus.
- https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982202004839
- https://www.nature.com/articles/nmeth1105-801
Ultimo aggiornamento: 11 giugno 2023
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